Cell | 免疫疾病中免疫细胞特异基因调控高效率全景图

2021-12-13 06:52:06 来源:
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东京大学的学术研究工作人员和RIKEN Research学术研究组的同事们现在建立了首个针对自身自体性疟疾和自身水肿性疟疾的蛋白质信息库。期盼这一自然资源能为自体疟疾的发展提供新的见解,并有可能有助于抑制剂的见到。科学家们还期盼,与自体关的的线粒体信息记事最终有可能广泛应用诸如COVID-19等传染病的学术研究。

东京大学新项目学术研究顾问,外科风湿病学家,机能线粒体学专业人士Mineto Ota博士问道:“要了解疟疾,就必须深刻忽略蛋白质变异的机能。有了这个信息集,我们就可以将与疟疾关的的DNA数列变化的信息与对疟疾中风机制非常关键的蛋白质和线粒体多种类型连系起来。”Ota是该小组发表在《Cell》Magazine上的社论的主要作者,社论结尾为“Dynamic landscape of immune cell-specific gene regulation in immune-mediated diseases”。该新项目是与Chugai Pharmaceutical的科学家们合作进行的。

作者写道,自体依赖性的疟疾(IMD)有数从自身自体性到自身水肿的多种病理。他们宣称,尽管IMD之中炎性线粒体因子的反常举办活动表明自体系统机能发生了变化,但是,“对于IMD的关的蛋白质甚至关的线粒体多种类型知之甚少。”

全线粒体相似性学术研究(GWAS)见到了许多与IMD关的的线粒体蛋白质座。但是,在此类相似性学术研究之中鉴定出新的许多蛋白质变异都毗邻调节蛋白质“on”或“off”表示的DNA非字节区域,而不是毗邻蛋白质字节数列之中。学术研究工作小组宣称:“GWAS现在揭示了许多与复杂个体和疟疾关的的线粒体蛋白质座,有数IMD。这些变异之中的大多数都毗邻非字节线粒体区域,尤其是转录组件,如增强子和启动子。”

为了揭示转录DNA的机能,一种完全有所不同多种类型的线粒体归纳,称为表示归纳方法个体蛋白质蛋白质座(eQTL),旨在将DNA数列的相异与蛋白质表示的相异连系起来。依靠eQTL信息,学术研究工作人员可以对转录DNA数列的目的、转录数列之中的变异如何影响其转录蛋白质的表示以及这些蛋白质表示相异如何导致疟疾做出新更加自大的猜测。

其它针对自体的eQTL学术研究现在在进行之中,但先前的学术研究工作只有数身心健康义工,并检查和了极小需求量的线粒体多种类型。学术研究工作人员写道:“对身心健康供体自体系统的学术研究有可能无法俘获疟疾平衡状态下见到的一系列eQTL震荡。此外,虽然对自体系统的实验性刺激可以在某种程度上实时疟疾平衡状态,但并不常常反映出新体内的环境因素环境。”

Ota补充道:“水肿平衡状态下,自体系统的物理特性与身心健康平衡状态下的有所不同线粒体截然完全有所不同。与自体状况关的的蛋白质变异有可能只在患病平衡状态下起作用,因此对于这种多种类型的蛋白质学术研究,从真实病人人身换取检验非常关键。”

在他们近期路透社的学术研究之中,学术研究工作小组对79名身心健康义工和337名被检验罹患10种完全有所不同多种类型自体依赖性疟疾(有数类风湿性关节炎、结构性红斑狼疮和结构性硬化症)的病人进行了全线粒体DNA。所有义工都是东洋血统。

了解自体依赖性的疟疾具说服力,因为尽管每种疟疾在外科上都是完全有所不同的,但仍有许多重合之处,并且具有所不同检验的病人有可能会发挥出新非常完全有所不同的症状。学术研究工作人员补充问道:“由于所有这些丰富性,一次学习一种自体依赖性疟疾的技能是极小的。但是,如果我们一起学术研究10种疟疾,就可以更加全面地了解这些多种类型的疟疾。”

在完成全线粒体DNA后,学术研究工作人员从义工的体内检验之中分离出新28种完全有所不同多种类型的自体关的线粒体,并校准了这些线粒体之中的蛋白质表示。“我们在记事之中看到,每种自体系统多种类型都有完全有所不同的eQTL结果,这可以告诉我们线粒体多种类型之间蛋白质转录的相异,以及哪种线粒体多种类型对于发展哪种疟疾至关关键。”学术研究工作人员问道。

作者报告问道,“在蛋白质表示归纳之中,我们在一个平台上对多个IMD进行比较,使我们很难描述每个疟疾(病人)的特质,并识别与单个疟疾依赖性关的的蛋白质,以及在三组IMD之中紊乱的通路……我们的信息集使我们很难检测每个特定线粒体多种类型之中eQTL震荡的环境因素(疟疾)取材驱动的阻碍。”

学术研究工作人员将得到的自然资源重新命名为东京大学自体系统蛋白质表示记事(ImmuNexUT),并问道它代表了使用亚洲各国血统义工建立的远超过的eQTL信息集。他们总结道:“我们已确定了自体系统多种类型依赖性的eQTL震荡,有数以前未路透社的罕见线粒体多种类型,它们在环境因素水肿先决条件下的丰富性,以及这些eQTL与IMD遗传之间的特别是在相似性。”

“到近期,在这一课题,大规模的线粒体和机能线粒体学术研究主要是依靠欧陆**进行的,尽管人群丰富性对于精确忽略线粒体机能至关关键。”学术研究工作人员问道,“这个东洋受试者的eQTL记事对于关键在于这种以欧陆为之中心的同性恋,联结欧陆的信息集实质性学术研究DNA变异的机能,也具关键象征意义。”

学术研究工作人员期盼ImmuNexUT信息库将暂时增长,并最终为病人助长更加好的结果。他们问道:“与此前路透社的自然资源相对来说,我们的信息集具独特而有利的特点,有数全面的自体系统拆分、**之间自体状况的变化以及同质的非欧陆**。”

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